Příčiny ohrožení hořečku mnohotvarého českého
Gentianella praecox subsp. bohemica
Absence vhodného managementu stanovišť
Na všech původně obhospodařovaných lokalitách přineslo ukončení pastvy či seče pro hořeček mnohotvarý český mnoho negativních změn vegetačních a světelných podmínek stanoviště. Po skončení extenzivní pastvy nastaly sukcesní změny na lokalitách provázené zarůstáním křovinami a konkurenčně zdatnějšími druhy bylin a trav. Tyto kompetičně zdatnější expanzivní a vitálnější druhy významně ohrožují v posledních desetiletích poslední populace hořečku, proto je pro jejich obnovu nutné zavést vhodný a pravidelný management – seč a pastvu.
Nesprávná pastva a seč však někdy mohou patřit mezi další faktory, které mohou negativně ovlivnit populace hořečku, proto je důležité zvolit správný management lokalit velmi citlivě.
Destrukce stanovišť
V minulosti zanikla řada lokalit přímou likvidací biotopu lidskou činností - rozoráváním luk a pastvin, zcelováním pozemků, zalesňováním či zástavbou.
Extrémně suché vegetační sezóny
Relativně novou hrozbu pro hořečky představují suché roky, tedy roky teplotně nadprůměrné a naopak srážkově podprůměrné. V těchto letech usychají jak jednoleté listové růžice, tak i rostliny ve druhém roce života, které se chystají kvést. Dochází tak k výpadku produce semen a oslabování semenné banky. Významný vliv to může představovat zejména pro malé a extrémně malé populace, zvlášťě opakují-li se tato období častěji. Na druhou stranu v těchto letech dochází k prosychání porostů jako takových a přirozeným způsobem se vytváří volné plochy obnažené půdy, které jsou optimální pro klíčení semen a růst malých hořečků na jaře následujícího roku.